lncRNA测序

服务简介

长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一类本身不参与编码蛋白，转录本长度大于200nt的RNA分子，它们能够在多层面上调控基因的表达，包括表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等。由于lncRNA中缺乏polyA结构，所以lncRNA测序是通过降低总RNA中rRNA的风度，对富集后的RNA进行文库构建病进行高通量测序，从而获得样本中大于200nt的非编码RNA信息的一种技术，从而使研究者们能够快速获得与特定生物学过程如细胞发育、疾病发生等相关的lncRNA信息。

技术流程

服务优势

• 云蜂生物提供从样品提取、建库测序到数据分析解读的一站式解决方案；
• 除了交付高质量的测序数据和各种常规性分析结果，我们从待解决的科学问题出发，对数据做深入的分析和挖掘，寻求科学问题的答案；
• 我们的分析报告包含发表质量的图表和详尽的结果描述，协助您快速完成文章撰写；
• 从项目方案设计开始，我们的项目负责人（三年以上基因组学研究经验）就全程负责项目执行，直到文章最终投稿发表；

服务流程与内容

• 项目设计方案优化：在项目前期，根据您的研究目的以经费预算，我们提供项目设计的优化和改进方案；
• 样品准备：我们可以接收多种不用类型的样本（包括血样，组织、唾液、血液以及FFPE样品），避免您花费大量精力准备合格的RNA样本；
• 样品提取与文库构建：使用QIAGEN公司的RNA提取试剂盒提取高质量的RNA，并对检测合格的RNA进行文库构建；
• 高通量测序：用Illumina公司最新的HiSeq 4000或者X10平台完成高通量测序, Single-end测序，reads读长50bp；
• 数据分析与解读：利用经过验证的标准化流程完成基本数据分析，并由专业的项目负责人（三年以上基因组研究经验）和您制定个性化分析计划，完成个性化分析任务；
• 提交分析结果和报告：完成数据分析后，提交原始测序数据、完整的数据分析结果和专业易懂的数据分析报告。

分析内容

对于lncRNA测序，我们提供以下分析

• 小RNA的分类与注释统计；
• 数据比对与转录本组装；
• lncRNA鉴定及功能预测；
• lncRNA定量及样本间差异分析；
• lncRNA家族预测分类；
• coding-non-coding共表达注释；
• Pathway富集分析；

参考文献