SmallRNA测序

服务简介

SmallRNA测序技术则是借助第二代高通量测序技术，对某物种某组织在特定状态下的18-30 nt（或18-40 nt）的small RNA进行高通量测序。继而通过数据库比对，对获得的small RNA序列进行分析、鉴定，将数百万条small RNA序列分类成rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA和miRNA等。另外，还可以通过miRNA前体的标志性发夹结构，预测新的miRNA，并对鉴定出的相应已知miRNA和新miRNA进行靶基因预测。通过对miRNA靶基因的相关分析，如GO分析和pathway 分析，可将鉴定出的miRNA与相应表型差异关联起来，从而为解释相关生理过程的调控机制提供证据。

技术流程

服务优势

• 云蜂生物提供从样品提取、建库测序到数据分析解读的一站式解决方案；
• 除了交付高质量的测序数据和各种常规性分析结果，我们从待解决的科学问题出发，对数据做深入的分析和挖掘，寻求科学问题的答案；
• 我们的分析报告包含发表质量的图表和详尽的结果描述，协助您快速完成文章撰写；
• 从项目方案设计开始，我们的项目负责人（三年以上基因组学研究经验）就全程负责项目执行，直到文章最终投稿发表；

服务流程与内容

• 项目设计方案优化：在项目前期，根据您的研究目的以经费预算，我们提供项目设计的优化和改进方案；
• 样品准备：我们可以接收多种不用类型的样本（包括血样，组织、唾液、血液以及FFPE样品），避免您花费大量精力准备合格的RNA样本；
• 样品提取与文库构建：使用QIAGEN公司的RNA提取试剂盒提取高质量的RNA，并对检测合格的RNA进行文库构建；
• 高通量测序：用Illumina公司最新的HiSeq 4000或者X10平台完成高通量测序, Single-end测序，reads读长50bp；
• 数据分析与解读：利用经过验证的标准化流程完成基本数据分析，并由专业的项目负责人（三年以上基因组研究经验）和您制定个性化分析计划，完成个性化分析任务；
• 提交分析结果和报告：完成数据分析后，提交原始测序数据、完整的数据分析结果和专业易懂的数据分析报告。

分析内容

对于小RNA测序，我们提供以下分析

• 小RNA的分类与注释统计；
• 已知小RNA的表达谱构建；
• 预测新的小RNA并绘制二级结构；
• 样品间小RNA差异表达分析；
• 靶基因预测及注释；
• mir2disease数据库注释；

参考文献